根據上述職責，湖南衡山經濟開發區管理委員會內設4個部室（局），級別均為副科級。

1、辦公室

負責情況綜合、統計、信息反饋；負責文件的收發、起草、繕印、分發、傳閱、立卷、歸檔等工作；對會議確定的事項予以催辦和督辦；協調領導班子成員之間，各部（室）之間的工作；負責機關接待、考勤、辦公用品采購、車輛管理、衛生管理等後勤保障工作；負責機關機構編製、計劃生育、人事政工等工作；協助招商合作局做好開發區對外宣傳、推介工作。

2、財務部

負責製定開發區財務計劃，監督各類資金使用情況；研究擬定實施有關財務管理製度、辦法；管理機構固定資產；負責區內財務監督檢查、審計和統計工作；負責投資、融資、項目還貸工作。

3、招商合作局

負責開發區招商工作，承擔宣傳和推介工作，組織或參與各項招商引資工作；負責開發區引資項目的行政審批代辦手續，提供“一站式”服務；協助開發區引進項目，做好引進前的一係列服務工作，組織、參與、調解項目籌建和生產期間發生的矛盾糾份，聯係“縣優化辦”和相關職能部門，監督執行“一費製”及“準入製”的規定；負責招商引資有功人員的獎勵申報和材料組織工作。

4、工程建設部（加掛綜合治理辦牌子）

貫徹執行上級有關征地拆遷政策規定，按年度用地計劃做好征地工作；編製年度用地計劃和征地拆遷實施方案，擬定征地拆遷用款計劃，負責與相關職能部門及科（室）銜接；擬定並執行拆遷補償標準，加強對征地補償資金的監管；做好征地拆遷中的調解工作，調處片地拆遷中的矛盾糾紛；負責征地範圍內項目用地清場工作，確保工程項目用地需求；協調組織項目用地報批，聯係辦理用地手續；審核項目投資額度，擬定供地方案，促進土地集約利用；製定經濟開發區規劃及工程建設管理的各項細則並組織實施；負責經濟開發區工程建設項目的立項、規劃、設計、評審、報批、報建等工作；組織實施經濟開發區自身承擔的工程項目的招投標，編製工程預、決算，擬定撥款計劃，負責工程項目的管理施工和竣工結算；負責工程項目施工過程跟蹤管理、設計技術變更、重大技術質量問題的處理，提出改進工程質量的方法、措施並組織實施；收集整理工程竣工驗收相關存檔資料；負責區內普法教育及社會治安綜合治理工作；負責區內治安保衛工作，維護社會秩序，查處治安案件；負責區內暫住人口管理工作。